En diciembre de 1582 fue enviado a Bolivia, a la ciudad de Potosí. Fue uno de los fundadores del Colegio de La Paz, inaugurado el 29 de septiembre de 1582. En 1583 la Audiencia de Charcas (actual Sucre) lo nombró Catedrático y Examinador diocesano de quechua, aymara y puquina.